OCCURRENCE

Garrapatas Rhipicephalus microplus (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Norte y Magdalena medio en Antioquia

Dernière version Publié par Universidad Pontificia Bolivariana le 20 février 2020 Universidad Pontificia Bolivariana
Este conjunto de datos corresponden a especímenes de garrapatas recolectadas en escenarios ganaderos del Magdalena Medio de Antioquia en el marco del proyecto financiado por la Universidad Pontificia Bolivariana -UPB Innova 2017 Radicado 823B-06/17-55 "Microbiota de Rhipicephalus microplus en ganaderías de Antioquía: estrategia de vigilancia de patógenos y prospección de agentes biocontroladores"

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme d'une Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant qu'ensemble d'un ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 10 enregistrements.

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Versions

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Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Gutierrez Builes L A, Segura Caro J A (2020): Garrapatas Rhipicephalus microplus (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Norte y Magdalena medio en Antioquia. v1.1. Universidad Pontificia Bolivariana. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/ncal7j

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Universidad Pontificia Bolivariana. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède l'UUID GBIF suivante : 2170737f-b704-448a-a6fd-5f358ffc32fd.  Universidad Pontificia Bolivariana publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec l'approbation du Colombian Biodiversity Information System.

Mots-clé

Occurrence; Observation; Ticks; Microbiology; Zoonoses; Cattle; PERMISO_COLECTA

Données externes

Les données de la ressource sont disponibles dans d'autres formats

Garrapatas Rhipicephalus microplus (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Norte y Magdalena medio en Antioquia https://ipt.biodiversidad.co/cr-sib/resource.do?r=744_microbiota_20200220 UTF-8 DWC-A

Contacts

Personne ayant créé cette ressource:

Lina Andrea Gutierrez Builes
Docente
Universidad Pontificia Bolivariana
Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones
050034 Medellin
Antioquia
CO
448838819333
Juan Aicardo Segura Caro
Estudiante de Doctorado en Ciencias Médicas
Universidad Pontificia Bolivariana
Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones
050034 Medellin
Antioquia
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Personne pouvant répondre aux questions sur la ressource:

Lina Andrea Gutierrez Builes
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Universidad Pontificia Bolivariana
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Lina Andrea Gutierrez Builes
Docente
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Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones
050034 Medellin
Antioquia
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Juan Aicardo Segura Caro
Estudiante de Doctorado en Ciencias Médicas
Universidad Pontificia Bolivariana
Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones
050034 Medellin
Antioquia
CO
448838819333

Autres personnes associées à la ressource:

Chercheur Principal
Lina Andrea Gutierrez Builes
Docente
Universidad Pontificia Bolivariana
Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones
050034 Medellin
Antioquia
CO
448838819333

Couverture géographique

Área de muestreo asociada a este proyecto

Enveloppe géographique Sud Ouest [5,797, -74,79], Nord Est [6,645, -74,456]

Couverture taxonomique

Los especímenes de garrapatas adultas asociados y analizados en este proyecto, correspondieron en su totalidad a la especie Rhipicephalus microplus

Species  Rhipicephalus microplus

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2017-08-16 / 2017-09-06

Données sur le projet

El objetivo general de este proyecto fue describir la microbiota intestinal y de glándulas salivales de la garrapata Rhipicephalus microplus en ganaderías de trópico alto y bajo de Antioquia.

Titre Microbiota de Rhipicephalus microplus en ganaderías de Antioquia: estrategia de vigilancia de patógenos y prospección de agentes biocontroladores
Identifiant UPB:823B-06/17-55:BG
Financement Esta investigación fue financiada por la Universidad Pontificia Bolivariana proyecto con número de radicado CIDI-UPB 823B-06/17-55.
Description du domaine d'étude / de recherche Esta investigación y el trabajo entomológico asociado fue realizado en fincas ganaderas ubicadas tanto en las regiones Norte y Magdalena medio de Antioquia.
Description du design Se recolectaron especímenes de garrapatas en bovinos de las zonas de estudio, se identificaron garrapata de la especie Rhipicephalus microplus, las cuales fueron microdisectadas para extraer las glándulas salivales y el intestino. Posteriormente, a partir de los tejidos obtendios se realizó cultivo bacteriologico y extracción de ADN y ARN genomicos. Se realizó la caracterización de las bacterias presentes mediante el análisis del gen 16S utilizando secuenciación de ADN masiva de alto rendimiento (NGS- Next Generation Sequencing) y su posterior análisis bioinformático. También se caracterizó el viroma asociado a la garrapata Rhipicephalus microplus, mediante un análisis RNAseq.

Les personnes impliquées dans le projet:

Chercheur Principal
Lina Andrea Gutierrez Builes
Auteur
Juan Aicardo Segura Caro

Méthodes d'échantillonnage

Se recolectaron especímenes de garrapatas en bovinos obtenidas mediante búsqueda directa: cada bovino seleccionado en las zonas Norte y Magdalena medio antioqueño para la búsqueda de garrapatas, fue manejado de forma individual mediante una inspección física visual y por palpación de la piel con el fin de recolectar especímenes de garrapatas por extracción manual de las garrapatas adultas >3.5mm. Cada inspección incluyo la búsqueda exhaustiva de artrópodos en las siguientes regiones anatómicas del bovino: cabeza, cuello, pabellón de las orejas, pecho, espalda, tren anterior, axilas, vientre, ubre, escroto, flancos, ingle, tren posterior, periné́ y cola y fueron transportadas al laboratorio para la extracción del ADN y ARN genomico.

Etendue de l'étude Fincas ganaderas ubicadas en la región norte y Magdalena medio de Antioquia.

Description des étapes de la méthode:

  1. La información detallada de la metodología, paso a paso, estará pronto disponible en artículos científicos que están en este momento en proceso de sometimiento. En uno de los artículos se realizará el reporte del análisis de la comunidad bacteriana detectada y en otro del viroma asociado con el análisis de los especímenes R. microplus. Estos artículos podrán encontrase asociados con el autor Segura et al, y Gómez et al por estar asociados al desarrollo de una tesis doctoral y una estancia posdoctoral, respectivamente.

Données de collection

Nom de la collection Colección de Invertebrados del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-I)
Identifiant de collection Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 003
Identifiant de la collection parente IAvH
Méthode de conservation des spécimens Alcohol
Unités de conservation Entre (nombre minimal) 2 951 et (nombre maximal) 2 954 Espécimen completo

Métadonnées additionnelles

Una vez aprobadas las publicaciones, los datos sobre las publicaciones asociadas a este proyecto y a los especímenes de garrapatas analizados, serán reportadas como metadatos adicionales.

Objet Asociado al permiso de colecta Nº 744 de 2016 concedido por el ANLA a la Universidad Pontificia Bolivariana.
Description de la fréquence de mise à jour Cada que sea necesario
Identifiants alternatifs 10.15472/ncal7j
2170737f-b704-448a-a6fd-5f358ffc32fd
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=744_microbiota_823b061755