Data Records
The data in this occurrence resource has been published as a Darwin Core Archive (DwC-A), which is a standardized format for sharing biodiversity data as a set of one or more data tables. The core data table contains 10 records.
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How to cite
Researchers should cite this work as follows:
Gutierrez Builes L A, Segura Caro J A (2020): Garrapatas Rhipicephalus microplus (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Norte y Magdalena medio en Antioquia. v1.1. Universidad Pontificia Bolivariana. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/ncal7j
Rights
Researchers should respect the following rights statement:
The publisher and rights holder of this work is Universidad Pontificia Bolivariana. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.
GBIF Registration
This resource has been registered with GBIF, and assigned the following GBIF UUID: 2170737f-b704-448a-a6fd-5f358ffc32fd. Universidad Pontificia Bolivariana publishes this resource, and is itself registered in GBIF as a data publisher endorsed by Colombian Biodiversity Information System.
Keywords
Occurrence; Observation; Ticks; Microbiology; Zoonoses; Cattle; PERMISO_COLECTA
External data
The resource data is also available in other formats
| Garrapatas Rhipicephalus microplus (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Norte y Magdalena medio en Antioquia | https://ipt.biodiversidad.co/cr-sib/resource.do?r=744_microbiota_20200220 UTF-8 DWC-A |
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Contacts
Who created the resource:
Who can answer questions about the resource:
Who filled in the metadata:
Who else was associated with the resource:
Geographic Coverage
Área de muestreo asociada a este proyecto
| Bounding Coordinates | South West [5.797, -74.79], North East [6.645, -74.456] |
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Taxonomic Coverage
Los especímenes de garrapatas adultas asociados y analizados en este proyecto, correspondieron en su totalidad a la especie Rhipicephalus microplus
| Species | Rhipicephalus microplus |
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Temporal Coverage
| Start Date / End Date | 2017-08-16 / 2017-09-06 |
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Project Data
El objetivo general de este proyecto fue describir la microbiota intestinal y de glándulas salivales de la garrapata Rhipicephalus microplus en ganaderías de trópico alto y bajo de Antioquia.
| Title | Microbiota de Rhipicephalus microplus en ganaderías de Antioquia: estrategia de vigilancia de patógenos y prospección de agentes biocontroladores |
|---|---|
| Identifier | UPB:823B-06/17-55:BG |
| Funding | Esta investigación fue financiada por la Universidad Pontificia Bolivariana proyecto con número de radicado CIDI-UPB 823B-06/17-55. |
| Study Area Description | Esta investigación y el trabajo entomológico asociado fue realizado en fincas ganaderas ubicadas tanto en las regiones Norte y Magdalena medio de Antioquia. |
| Design Description | Se recolectaron especímenes de garrapatas en bovinos de las zonas de estudio, se identificaron garrapata de la especie Rhipicephalus microplus, las cuales fueron microdisectadas para extraer las glándulas salivales y el intestino. Posteriormente, a partir de los tejidos obtendios se realizó cultivo bacteriologico y extracción de ADN y ARN genomicos. Se realizó la caracterización de las bacterias presentes mediante el análisis del gen 16S utilizando secuenciación de ADN masiva de alto rendimiento (NGS- Next Generation Sequencing) y su posterior análisis bioinformático. También se caracterizó el viroma asociado a la garrapata Rhipicephalus microplus, mediante un análisis RNAseq. |
The personnel involved in the project:
Sampling Methods
Se recolectaron especímenes de garrapatas en bovinos obtenidas mediante búsqueda directa: cada bovino seleccionado en las zonas Norte y Magdalena medio antioqueño para la búsqueda de garrapatas, fue manejado de forma individual mediante una inspección física visual y por palpación de la piel con el fin de recolectar especímenes de garrapatas por extracción manual de las garrapatas adultas >3.5mm. Cada inspección incluyo la búsqueda exhaustiva de artrópodos en las siguientes regiones anatómicas del bovino: cabeza, cuello, pabellón de las orejas, pecho, espalda, tren anterior, axilas, vientre, ubre, escroto, flancos, ingle, tren posterior, periné́ y cola y fueron transportadas al laboratorio para la extracción del ADN y ARN genomico.
| Study Extent | Fincas ganaderas ubicadas en la región norte y Magdalena medio de Antioquia. |
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Method step description:
- La información detallada de la metodología, paso a paso, estará pronto disponible en artículos científicos que están en este momento en proceso de sometimiento. En uno de los artículos se realizará el reporte del análisis de la comunidad bacteriana detectada y en otro del viroma asociado con el análisis de los especímenes R. microplus. Estos artículos podrán encontrase asociados con el autor Segura et al, y Gómez et al por estar asociados al desarrollo de una tesis doctoral y una estancia posdoctoral, respectivamente.
Collection Data
| Collection Name | Colección de Invertebrados del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-I) |
|---|---|
| Collection Identifier | Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 003 |
| Parent Collection Identifier | IAvH |
| Specimen preservation methods | Alcohol |
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| Curatorial Units | Between 2,951 and 2,954 Espécimen completo |
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Additional Metadata
Una vez aprobadas las publicaciones, los datos sobre las publicaciones asociadas a este proyecto y a los especímenes de garrapatas analizados, serán reportadas como metadatos adicionales.
| Purpose | Asociado al permiso de colecta Nº 744 de 2016 concedido por el ANLA a la Universidad Pontificia Bolivariana. |
|---|---|
| Maintenance Description | Cada que sea necesario |
| Alternative Identifiers | 10.15472/ncal7j |
| 2170737f-b704-448a-a6fd-5f358ffc32fd | |
| https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=744_microbiota_823b061755 |