Garrapatas Rhipicephalus microplus (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Norte y Magdalena medio en Antioquia

Última versión Publicado por Universidad Pontificia Bolivariana en Feb 20, 2020 Universidad Pontificia Bolivariana

Este conjunto de datos corresponden a especímenes de garrapatas recolectadas en escenarios ganaderos del Magdalena Medio de Antioquia en el marco del proyecto financiado por la Universidad Pontificia Bolivariana -UPB Innova 2017 Radicado 823B-06/17-55 "Microbiota de Rhipicephalus microplus en ganaderías de Antioquía: estrategia de vigilancia de patógenos y prospección de agentes biocontroladores"

Registros

Los datos en este registros biológicos recurso han sido publicados como Archivo Darwin Core(DwC-A), el cual es un formato estándar para compartir datos de biodiversidad como un conjunto de una o más tablas de datos. La tabla de datos del core contiene 10 registros.

Este IPT archiva los datos, sirviendo así como repositorio de datos. Los datos y metadatos están disponibles para descargar en la sección de descargas. La tabla de versiones muestra otras versiones del recurso que se han hecho accesibles al público y permite el seguimiento de los cambios hechos al recurso en el tiempo.

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Versiones

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¿Cómo referenciar?

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Gutierrez Builes L A, Segura Caro J A (2020): Garrapatas Rhipicephalus microplus (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Norte y Magdalena medio en Antioquia. v1.1. Universidad Pontificia Bolivariana. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/ncal7j

Derechos

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El publicador y propietario de los derechos de este trabajo es Universidad Pontificia Bolivariana. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

Registro GBIF

Este recurso ha sido registrado en GBIF con el siguiente UUID: 2170737f-b704-448a-a6fd-5f358ffc32fd.  Universidad Pontificia Bolivariana publica este recurso, y está registrado en GBIF como un publicador de datos avalado por Colombian Biodiversity Information System.

Palabras Clave

Occurrence; Observation; Ticks; Microbiology; Zoonoses; Cattle; PERMISO_COLECTA

Datos externos

Los datos del recurso también están disponibles en otros formatos

Garrapatas Rhipicephalus microplus (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Norte y Magdalena medio en Antioquiahttps://ipt.biodiversidad.co/cr-sib/resource.do?r=744_microbiota_20200220 UTF-8 DWC-A

Contactos

¿Quién creó el recurso?:

Lina Andrea Gutierrez Builes
Docente
Universidad Pontificia Bolivariana Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones 050034 Medellin Antioquia CO 448838819333
Juan Aicardo Segura Caro
Estudiante de Doctorado en Ciencias Médicas
Universidad Pontificia Bolivariana Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones 050034 Medellin Antioquia CO 448838819333

¿Quién puede resolver dudas acerca del recurso?:

Lina Andrea Gutierrez Builes
Docente
Universidad Pontificia Bolivariana Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones 050034 Medellin Antioquia CO 448838819333

¿Quién documentó los metadatos?:

Lina Andrea Gutierrez Builes
Docente
Universidad Pontificia Bolivariana Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones 050034 Medellin Antioquia CO 448838819333
Juan Aicardo Segura Caro
Estudiante de Doctorado en Ciencias Médicas
Universidad Pontificia Bolivariana Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones 050034 Medellin Antioquia CO 448838819333

¿Quién más está asociado con el recurso?:

Investigador Principal
Lina Andrea Gutierrez Builes
Docente
Universidad Pontificia Bolivariana Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones 050034 Medellin Antioquia CO 448838819333

Cobertura Geográfica

Área de muestreo asociada a este proyecto

Coordenadas límite Latitud Mínima Longitud Mínima [5.797, -74.79], Latitud Máxima Longitud Máxima [6.645, -74.456]

Cobertura Taxonómica

Los especímenes de garrapatas adultas asociados y analizados en este proyecto, correspondieron en su totalidad a la especie Rhipicephalus microplus

Especie  Rhipicephalus microplus

Cobertura Temporal

Fecha Inicial / Fecha Final 2017-08-16 / 2017-09-06

Datos del Proyecto

El objetivo general de este proyecto fue describir la microbiota intestinal y de glándulas salivales de la garrapata Rhipicephalus microplus en ganaderías de trópico alto y bajo de Antioquia.

Título Microbiota de Rhipicephalus microplus en ganaderías de Antioquia: estrategia de vigilancia de patógenos y prospección de agentes biocontroladores
Identificador UPB:823B-06/17-55:BG
Fuentes de Financiación Esta investigación fue financiada por la Universidad Pontificia Bolivariana proyecto con número de radicado CIDI-UPB 823B-06/17-55.
Descripción del Área de Estudio Esta investigación y el trabajo entomológico asociado fue realizado en fincas ganaderas ubicadas tanto en las regiones Norte y Magdalena medio de Antioquia.
Descripción del Diseño Se recolectaron especímenes de garrapatas en bovinos de las zonas de estudio, se identificaron garrapata de la especie Rhipicephalus microplus, las cuales fueron microdisectadas para extraer las glándulas salivales y el intestino. Posteriormente, a partir de los tejidos obtendios se realizó cultivo bacteriologico y extracción de ADN y ARN genomicos. Se realizó la caracterización de las bacterias presentes mediante el análisis del gen 16S utilizando secuenciación de ADN masiva de alto rendimiento (NGS- Next Generation Sequencing) y su posterior análisis bioinformático. También se caracterizó el viroma asociado a la garrapata Rhipicephalus microplus, mediante un análisis RNAseq.

Personas asociadas al proyecto:

Investigador Principal
Lina Andrea Gutierrez Builes
Autor
Juan Aicardo Segura Caro

Métodos de Muestreo

Se recolectaron especímenes de garrapatas en bovinos obtenidas mediante búsqueda directa: cada bovino seleccionado en las zonas Norte y Magdalena medio antioqueño para la búsqueda de garrapatas, fue manejado de forma individual mediante una inspección física visual y por palpación de la piel con el fin de recolectar especímenes de garrapatas por extracción manual de las garrapatas adultas >3.5mm. Cada inspección incluyo la búsqueda exhaustiva de artrópodos en las siguientes regiones anatómicas del bovino: cabeza, cuello, pabellón de las orejas, pecho, espalda, tren anterior, axilas, vientre, ubre, escroto, flancos, ingle, tren posterior, periné́ y cola y fueron transportadas al laboratorio para la extracción del ADN y ARN genomico.

Área de Estudio Fincas ganaderas ubicadas en la región norte y Magdalena medio de Antioquia.

Descripción de la metodología paso a paso:

  1. La información detallada de la metodología, paso a paso, estará pronto disponible en artículos científicos que están en este momento en proceso de sometimiento. En uno de los artículos se realizará el reporte del análisis de la comunidad bacteriana detectada y en otro del viroma asociado con el análisis de los especímenes R. microplus. Estos artículos podrán encontrase asociados con el autor Segura et al, y Gómez et al por estar asociados al desarrollo de una tesis doctoral y una estancia posdoctoral, respectivamente.

Datos de la Colección

Nombre de la Colección Colección de Invertebrados del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-I)
Identificador de la Colección Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 003
Identificador de la Colección Parental IAvH
Métodos de preservación de los ejemplares Alcohol
Unidades Curatoriales Entre 2,951 y 2,954 Espécimen completo

Metadatos Adicionales

Una vez aprobadas las publicaciones, los datos sobre las publicaciones asociadas a este proyecto y a los especímenes de garrapatas analizados, serán reportadas como metadatos adicionales.

Propósito Asociado al permiso de colecta Nº 744 de 2016 concedido por el ANLA a la Universidad Pontificia Bolivariana.
Descripción de mantenimiento Cada que sea necesario
Identificadores Alternativos 10.15472/ncal7j
2170737f-b704-448a-a6fd-5f358ffc32fd
https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=744_microbiota_823b061755