10.15472/ncal7j 2170737f-b704-448a-a6fd-5f358ffc32fd https://ipt.biodiversidad.co/sib/resource?r=744_microbiota_823b061755 Garrapatas Rhipicephalus microplus (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Norte y Magdalena medio en Antioquia Lina Andrea Gutierrez Builes Universidad Pontificia Bolivariana Docente
Calle 78B #72A-109, Bloque B (cuarto piso) Laboratorio de investigaciones Medellin Antioquia 050034 CO
448838819333 lina.gutierrezb@upb.edu.co https://orcid.org/0000-0002-5336-6984
Juan Aicardo Segura Caro Universidad Pontificia Bolivariana Estudiante de Doctorado en Ciencias Médicas
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448838819333 juan.segurac@upb.edu.co 0000-0003-4231-5724
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448838819333 lina.gutierrezb@upb.edu.co https://orcid.org/0000-0002-5336-6984 principalInvestigator
2020-02-20 spa Este conjunto de datos corresponden a especímenes de garrapatas recolectadas en escenarios ganaderos del Magdalena Medio de Antioquia en el marco del proyecto financiado por la Universidad Pontificia Bolivariana -UPB Innova 2017 Radicado 823B-06/17-55 "Microbiota de Rhipicephalus microplus en ganaderías de Antioquía: estrategia de vigilancia de patógenos y prospección de agentes biocontroladores" Occurrence GBIF Dataset Type Vocabulary: http://rs.gbif.org/vocabulary/gbif/dataset_type.xml Observation GBIF Dataset Subtype Vocabulary: http://rs.gbif.org/vocabulary/gbif/dataset_subtype.xml Ticks Microbiology Zoonoses Cattle MeSH PERMISO_COLECTA SiB Colombia Una vez aprobadas las publicaciones, los datos sobre las publicaciones asociadas a este proyecto y a los especímenes de garrapatas analizados, serán reportadas como metadatos adicionales. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License. Área de muestreo asociada a este proyecto -74.79 -74.456 6.645 5.797 2017-08-16 2017-09-06 Los especímenes de garrapatas adultas asociados y analizados en este proyecto, correspondieron en su totalidad a la especie Rhipicephalus microplus species Rhipicephalus microplus Asociado al permiso de colecta Nº 744 de 2016 concedido por el ANLA a la Universidad Pontificia Bolivariana. Cada que sea necesario asNeeded Lina Andrea Gutierrez Builes Universidad Pontificia Bolivariana Docente
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La información detallada de la metodología, paso a paso, estará pronto disponible en artículos científicos que están en este momento en proceso de sometimiento. En uno de los artículos se realizará el reporte del análisis de la comunidad bacteriana detectada y en otro del viroma asociado con el análisis de los especímenes R. microplus. Estos artículos podrán encontrase asociados con el autor Segura et al, y Gómez et al por estar asociados al desarrollo de una tesis doctoral y una estancia posdoctoral, respectivamente. Fincas ganaderas ubicadas en la región norte y Magdalena medio de Antioquia. Se recolectaron especímenes de garrapatas en bovinos obtenidas mediante búsqueda directa: cada bovino seleccionado en las zonas Norte y Magdalena medio antioqueño para la búsqueda de garrapatas, fue manejado de forma individual mediante una inspección física visual y por palpación de la piel con el fin de recolectar especímenes de garrapatas por extracción manual de las garrapatas adultas >3.5mm. Cada inspección incluyo la búsqueda exhaustiva de artrópodos en las siguientes regiones anatómicas del bovino: cabeza, cuello, pabellón de las orejas, pecho, espalda, tren anterior, axilas, vientre, ubre, escroto, flancos, ingle, tren posterior, periné́ y cola y fueron transportadas al laboratorio para la extracción del ADN y ARN genomico. Microbiota de Rhipicephalus microplus en ganaderías de Antioquia: estrategia de vigilancia de patógenos y prospección de agentes biocontroladores Lina Andrea Gutierrez Builes https://orcid.org/0000-0002-5336-6984 principalInvestigator Juan Aicardo Segura Caro 0000-0003-4231-5724 author El objetivo general de este proyecto fue describir la microbiota intestinal y de glándulas salivales de la garrapata Rhipicephalus microplus en ganaderías de trópico alto y bajo de Antioquia. Esta investigación fue financiada por la Universidad Pontificia Bolivariana proyecto con número de radicado CIDI-UPB 823B-06/17-55. Esta investigación y el trabajo entomológico asociado fue realizado en fincas ganaderas ubicadas tanto en las regiones Norte y Magdalena medio de Antioquia. Se recolectaron especímenes de garrapatas en bovinos de las zonas de estudio, se identificaron garrapata de la especie Rhipicephalus microplus, las cuales fueron microdisectadas para extraer las glándulas salivales y el intestino. Posteriormente, a partir de los tejidos obtendios se realizó cultivo bacteriologico y extracción de ADN y ARN genomicos. Se realizó la caracterización de las bacterias presentes mediante el análisis del gen 16S utilizando secuenciación de ADN masiva de alto rendimiento (NGS- Next Generation Sequencing) y su posterior análisis bioinformático. También se caracterizó el viroma asociado a la garrapata Rhipicephalus microplus, mediante un análisis RNAseq.
2020-01-24T01:16:37.044+00:00 dataset Gutierrez Builes L A, Segura Caro J A (2020): Garrapatas Rhipicephalus microplus (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Norte y Magdalena medio en Antioquia. v1.1. Universidad Pontificia Bolivariana. Dataset/Occurrence. https://doi.org/10.15472/ncal7j Garrapatas Rhipicephalus microplus (Acari: Ixodidae) de zonas ganaderas del Norte y Magdalena medio en Antioquia UTF-8 DWC-A https://ipt.biodiversidad.co/cr-sib/resource.do?r=744_microbiota_20200220 https://statics.sibcolombia.net/sib-resources/images/logos-socios/500px/upb.jpg IAvH Registro Nacional de Colecciones Biológicas: 003 Colección de Invertebrados del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (IAvH-I) alcohol Espécimen completo 2951 2954 2170737f-b704-448a-a6fd-5f358ffc32fd/v1.1.xml