Herbario virtual bosques secos de Colombia - sección herbario FMB (IAvH)

Descrição

Registros de Dados

Os dados deste recurso de ocorrência foram publicados como um Darwin Core Archive (DwC-A), que é o formato padronizado para compartilhamento de dados de biodiversidade como um conjunto de uma ou mais tabelas de dados. A tabela de dados do núcleo contém 5.067 registros.

Também existem 1 tabelas de dados de extensão. Um registro de extensão fornece informações adicionais sobre um registro do núcleo. O número de registros em cada tabela de dados de extensão é ilustrado abaixo.

This IPT archives the data and thus serves as the data repository. The data and resource metadata are available for download in the downloads section. The versions table lists other versions of the resource that have been made publicly available and allows tracking changes made to the resource over time.

Downloads

Baixe a última versão do recurso de dados, como um Darwin Core Archive (DwC-A) ou recurso de metadados, como EML ou RTF:

Versões

A tabela abaixo mostra apenas versões de recursos que são publicamente acessíveis.

Como citar

Pesquisadores deveriam citar esta obra da seguinte maneira:

Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2014). Herbario virtual Bosques Secos de Colombia- Sección Herario FMB (IAvH). 5067 registros, aportados por: González, R. (Contacto del recurso, Creador del recurso, Investigador principal), Quintana, A. (Proveedor de metadatos), Piñeros, P. (Procesador). Versión 9.1. http://doi.org/10.15472/t4bht1

Direitos

Pesquisadores devem respeitar a seguinte declaração de direitos:

O editor e o detentor dos direitos deste trabalho é Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt. This work is licensed under a Creative Commons Attribution Non Commercial (CC-BY-NC) 4.0 License.

GBIF Registration

Este recurso foi registrado no GBIF e atribuído ao seguinte GBIF UUID: de45bd59-54e6-4f62-9a15-b481af99fc48.  Instituto de Investigación de Recursos Biológicos Alexander von Humboldt publica este recurso, e está registrado no GBIF como um publicador de dados aprovado por Colombian Biodiversity Information System.

Palavras-chave

bosque seco tropical; ejemplar de herbario; colección botánica; herbario virtual; Plantae; Occurrence; Observation

Dados externos

Os dados de recurso também estão disponíveis em outros formatos

Contatos

Cobertura Geográfica

El conjunto de datos contiene información de los ejemplares botánicos de bosque seco tropical de Colombia, con énfasis es localidades del Caribe Colombiano, los valles geográficos de los ríos Magdalena, el valle del cañón del río Patía. Abarca los departamentos de Atlántico, Bolívar, Caldas, Cauca, Cundinamarca, Huila, La Guajira, Magdalena, Sucre, Tolima y San Andrés y Providencia.

Cobertura Taxonômica

Por medio de la búsqueda de especímenes pertenecientes a Bosque Seco Tropical de Colombia, depositados en el herbario FMB, del Instituto de Investigación de Recursos Biológicos "Alexander von Humboldt", se consolidaron 5067 registros de ejemplares botánicos correspondientes a 148 Familias, 779 géneros y 1843 especies. Se utilizó el código APG III como sistema de clasificación de las especies y las actualizaciones nomenclaturales se realizaron con base en los datos proporcionados en los recursos The Plant List (http://www.theplantlist.org/), Tropicos (http://www.theplantlist.org/) y IPNI (http://www.ipni.org/)

Cobertura Temporal

Dados Sobre o Projeto

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O pessoal envolvido no projeto:

Métodos de Amostragem

Los datos contenidos en este recurso pertenecen a ejemplares de bosque seco tropical del Herbario FMB que fueron digitalizados y publicados en el recurso electrónico "Herbario virtual FMB" y compartidos en el "Herbario virtual Bosques Secos de Colombia", a través de FlickR. Los exicados fueron seleccionados por la localidad en la que fueron colectados (la cual debe pertenecer a bosque seco tropical). Estos ejemplares se seleccionaron en la base de datos del herbario, posteriormente se ubicaron en la colección y fueron extraídos de la misma para transportarlos al laboratorio de fotografía del herbario FMB.

Descrição dos passos do método:

1. La digitalización de especímenes se refiere a la captura fotográfica y el registro de información de especímenes o colecciones. Típicamente los especímenes incluyen etiquetas y notas de campo que contienen información sobre el evento de colecta (Ejemplo: Nombre del colector, fechas, Localidad, etc.) determinaciones taxonómicas y números de catálogo o identificadores. La digitalización de la información de las etiquetas incluye captura del texto como caracteres, y almacenamiento de esta información en bases de datos, igualmente la digitalización también incluye la captura de imágenes digitales. El proceso de digitalización incluye las siguientes tareas: 1.Curado y pre-digitalización 2.Captura de imágenes (fotografía de especímenes y etiquetas) 3.Procesamiento de las imágenes 4.Captura electrónica de los datos 1.CURADO Y PRE-DIGITALIZACIÓN Constituye el primer paso en la digitalización de especímenes y brinda la oportunidad de realizar las siguientes actividades: -Inspeccionar y restaurar los especímenes dañados y evaluar la salud de la colección. -Tratar las pestes. -Descubrir especímenes perdidos pertenecientes a otras instituciones o tipos no conocidos en la colección. -Actualizar las determinaciones taxonómicas. -Reorganizar los contenidos de los gabinetes o compactadores. -Seleccionar los ejemplares para la digitalización. -Adjuntar un identificador único (Código de barras) a cada espécimen. 2.CAPTURA DE IMÁGENES (fotografía de especímenes y etiquetas) La captura de imágenes consiste en fotografiar los ejemplares codificados previamente y descargar las imágenes en el computador destinado para la edición y marcaje. Durante el proceso de fotografía de una familia se debe llevar un registro detallado de las diferentes actividades realizadas. A continuación se explican los pasos y se dan las instrucciones necesarias para el proceso de Captura de imagen. La captura de imágenes generalmente requiere: -Pre-configuración e iniciación de los equipos. -Organización de los especímenes que serán fotografiados. -Toma de la imagen. -Descarga y almacenamiento de la imagen. -Captura del código de barras. -Mover el espécimen a una nueva estación o incluirlo nuevamente en la colección. 3.PROCESAMIENTO DE LAS IMÁGENES El procesamiento de las imágenes incluye todas las tareas o grupo de tareas desarrolladas sobre una imagen, seis tareas son las más comunes: 1.Control de calidad. 2.Procesamiento de la imagen. 3.Conversión de archivos. 4.Copia de Seguridad. Durante el procesamiento de la imagen se debe llevar un registro detallado de las diferentes actividades realizadas. Para este proceso se parte de la fotografía descargada en rutas preestablecidas. 4.CAPTURA ELECTRÓNICA DE LOS DATOS La captura electrónica de datos involucra la extracción de datos de las etiquetas y la digitalización de estos datos en una base de datos electrónica. Según este protocolo la captura de datos debe ser después de la captura de la imagen. En las colecciones donde una gran cantidad especímenes son fotografiados, los datos son tomados directamente de las imágenes, reduciendo las posibilidades de daño en los múltiples viajes de los especímenes. Existen muchas formas de capturar la información de las etiquetas de herbario, pero la más común es mediante la digitalización directa en una plantilla estándar, como las ofrecidas por el formato DarwinCore. En nuestro proyecto “Cerrando la brecha entre parcelas permanentes y la conservación de plantas en Colombia” trabajaremos con las plantillas DwC para la documentación de registros biológicos. Esta plantilla se encuentra adjunta a este documento. El estándar Darwin Core (Versión 2011-10-26) está conformado por 175 elementos, de los cuáles solo cinco son obligatorios (ID del Registro biológico, Base del registro, Código de la institución, Código de la colección, Número de catálogo). Nosotros trabajaremos con 92 elementos comunes y 36 elementos de extensión que incluirán información sobre las imágenes y los rasgos funcionales tomados de los especímenes de herbario.

Dados de Coleção

Citações bibliográficas

1. Smith, N.,Mori, S.,Henderson, A., Stevenson, D. & Heald, S. (2004).Flowering Plants of the Neotropics. Princeton University. New Jersey. 594 p.
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3. Mendoza, H., Ramírez, B.(2006). Guía Ilustrada de Géneros de Melastomataceae y Memecylaceae de Colombia. Instituto de Investigación en Recursos Biológicos Alexander von Humboldt. Bogotá. 288 p.
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5. Missouri Botanical Garden. Trópicos, 49163 registros. En Línea, http://www.tropicos.org/Home.aspx, publicado el 13/01/2014
6. Gentry, A. H. (1993). A Field Guide to the Families and Genera of Woody Plants of Northwest South America (Colombia, Ecuador, Perú). Washington: Conservation International
7. The Plant List (2013). Version 1.1. Published on the Internet; http://www.theplantlist.org/ http://www.theplantlist.org/1.1/cite/
8. Instituto de Investigación en Recursos Biológicos Alexander von Humboldt (2013). Protocolo para la Digitalización de Especímenes de Herbario, Versión 1.0. Bogotá. 19 p.

Metadados Adicionais