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Asociación de las variables meteorológicos con la presencia de Cryptococcus spp en aislamientos ambientales en Cúcuta

La Criptococosis es un problema de salud pública que afecta principalmente a pacientes inmunocomprometidos especialmente a paciente con SIDA aunque puede afectar a paciente inmunocompetentes su agente causal es Cryptococcus neoformans, Cryptococcus gatti. Los resultados de un estudio restrospectivo de la epidemiologia y manifestaciones clínicas de infecciones en Colombia entre el año 1997-2011 demostró que la Criptococosis causada por C. gattii tiene una baja prevalencia en Colombia, exceptuando a Norte de Santander. El predominio del tipo molecular VGII es preocupante teniendo en cuenta su asociación con alta virulencia y el potencial para convertirse en brotes. A partir de 1209 encuestas analizadas entre 1997 a 2011 en Colombia, se notificaron 45 casos causados por C. gattii (prevalencia del 3,7%; incidencia anual 0,07 casos / millón de habitantes / año). Norte de Santander tiene una alta incidencia a nivel nacional (0,81 casos / millón / año), lo que representa el 33,3% de todos los caso. El objetivo de esta investigación es establecer la relación genética y proteómica entre aislados clínicos y ambientales de Cryptococcus neoformans y Cryptococcus gatti en el municipio de San José de Cúcuta, Norte de Santander. Para el desarrollo de esta investigación el diseño del estudio será correlacional. Se evaluarán muestras ambientales en el parques General Santander y la sede de la Universidad de Santander del municipio Cúcuta para lo cual se recolectaran muestras de excretas de aves, suelo, corteza, hojas y frutos de árboles de diferentes de árboles en parques públicos del área metropolitana de la ciudad, Estas muestras serán procesadas mediante la técnica de extracción de buffer fosfato salino suplementando con antibiótico, posteriormente se siembran en agar semilla de girasol y se incuban a 27°C durante 20 días; Las colonias cremosas, elevadas, con bordes regulares y pigmento café se les hará una prueba de degradación de urea y Agar canavanina glicina azul de bromotimol sódico. Los aislados serán identificados por espectrometría de masas utilizando la tecnología MALDI TOF . Concomitantemente a la toma de muestra se realiza registro de las variantes meteorológicas, las anomalías en las temperaturas se descargaran de la Administración Nacional Oceánica y Atmosférica (NOAA) y los datos de precipitación serán proporcionados por el Instituto de Hidrología, Meteorología y Estudios Ambientales (IDEAM). Posteriormente mediante el Sistema de Información Geográfica (SIG) software ArcGis v 10.2.16 y ArcView GIS 3.2 (Environmental Systems Research Institute Inc., Redlands, CA) se realizará la asociación entre variantes meteorológicas y aislamientos ambientales.

Certificado en PDF
Número del certificado16ED2A06CB2
Fecha del certificado2019-12-04
Certificado en PDFdescargar (59 KB)
Contacto del recurso
NombreAsbleide Karina Angarita Sánchez
PosiciónInvestigadora principal
OrganizaciónUniversidad de Santander
Dirección Campus UDES Cúcuta, Urbanización El Bosque, Avenida 4 10N-61, Cúcuta, Norte de Santander, COLOMBIA, Código postal: 540003
Contactoas.angarita@mail.udes.edu.co Tel: 5791008
Página Webhttp://www.udes.edu.co
Contacto del permiso
NombreJaime De Jesús Restrepo Cuartas
PosiciónRepresentante Legal
OrganizaciónUniversidad de Santander
Dirección Campus Lagos del Cacique Calle 70 No 55-210, Bucaramanga, Santander, COLOMBIA, Código postal: 680003
Contactojrestrepo@udes.edu.co Tel: 6516500
Página Webhttp://www.udes.edu.co
Proveedor de los metadatos
NombreEliana Narváez Parra
PosiciónDocente de apoyo Vicerrectoría de Investigaciones
OrganizaciónUniversidad de Santander
Dirección Campus Lagos del Cacique Calle 70 No 55-210, Bucaramanga, Santander, COLOMBIA, Código postal: 680003
Contactoenarvaez@udes.edu.co Tel: 6516500
Página Webhttp://www.udes.edu.co
Información del Permiso
Autoridad ambientalAutoridad Nacional de Licencias Ambientales
Número del permiso01749
Titular del permisoUniversidad de Santander
Nit o cédula804001890-1
Fecha de emisión2017-12-29
Cobertura Geográfica
DescripciónEste estudio se realizará en la zona metropolitana de la ciudad de Cúcuta específicamente los puntos son: Universidad de Santander, Alrededores del estadio General Santander y Parque Santander. Parque Santander, Cúcuta, Colombia Latitud decimal 7.886306749999999 Longitud decimal 72.50426811640008, 315m; Universidad de Santander - UDES, Cúcuta, Colombia Latitud decimal 7.9095286 Longitud decimal -72.4967566, 291m; Alrededores del estadio(Plaza Banderas), Cúcuta, Colombia Latitud decimal 7.8929318 Longitud decimal -72.5018809, 302m.
Coordenadas7.886, 7.91 / -72.497, 72.504 (Latitud mínima, máxima / Longitud mínima/máxima)
Cobertura Taxonómica
Descripción Con este estudio se pretende identificar desde la categoría taxonómica familia hasta la categoría taxonómica patrón molecular.
Especie Cryptococcus neoformans, Cryptococcus gattii
Cobertura Temporal
Fecha inicial / Fecha final2019-07-26 / 2019-08-30
Métodos de Muestreo
Descripción del muestreoLas muestras de suelo, corteza de árboles y excretas de paloma se recolectarán en bolsas plásticas 10 g aproximadamente. Estas muestras serán procesadas mediante la técnica de extracción de buffer fosfato salino (PBS) suplementando con antibiotico (Paliwal and Randhawa 1978; Escandón, Quintero et al 2005), la cual consiste en pesar 5 g de muestra, resuspenderla en 25 ml de PBS 1X, homogenizar y dejar en reposo durante una hora.
Datos del Proyecto
TítuloAsociación de las variables meteorológicos con la presencia de Cryptococcus spp en aislamientos ambientales en Cúcuta
(Personal) Nombre Asbleide Karina Angarita Sánchez
(Personal) Rol Investigador Principal
Fuentes de financiaciónConvocatoria de interés institucional Universidad de Santander
Descripción del área de estudioEste estudio se realizará en la zona metropolitana de la ciudad de Cúcuta específicamente los puntos son: Universidad de Santander, Alrededores del estadio General Santander y Parque Santander.
Descripción del proyectoEl diseño del estudio será de naturaleza descriptiva y correlacional. Se evaluarán muestras de suelo, corteza de árboles y excretas en alrededores del Estadio General Santander, Parque General Santander y Universidad de Santander Campus Cúcuta, para el aislamiento de Cryptococcus sp. y posteriormente se realizará registro de las condiciones meteorológicas para continuar con la asociación de los asilados con la temperatura y precipitación.
Palabras Clave
Cryptococcus; Cúcuta; Nichos ambientales
Parte Asociada 1
NombreClaudia Marcela Parra Giraldo
PosiciónDocente
OrganizaciónUnidad de Investigación en Proteómica y Micosis Humanas
Dirección Carrera 7 No. 43-82, Edificio Carlos Ortiz (52), Laboratorio 404 Facultad de Ciencias, Pontificia Universidad Javeriana., Bogotá, Cundinamarca, COLOMBIA, Código postal: 110231
ContactoClaudia.parra@javeriana.edu.co Tel: 3143175348
Página Webhttps://www.javeriana.edu.co
Rol Autor